Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHL1

Slc9a3r2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r2Q9JHL1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms