Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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OtofQ9ESF1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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OtofQ9ESF1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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OtofQ9ESF1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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OtofQ9ESF1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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