Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Usp29Q9ES63 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
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Usp29Q9ES63 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Usp29Q9ES63 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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