Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms