Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms