Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dap3Q9ER88 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms