Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn4aQ9ER60 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms