Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms