Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH4

Taf8, Transcription initiation factor TFIID subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf8Q9EQH4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf8Q9EQH4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf8Q9EQH4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms