Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ52

Vmn1r48, Vomeronasal type-1 receptor 48, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r48Q9EQ52 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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