Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cxcr6Q9EQ16 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr6Q9EQ16 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms