Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms