Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS4

Vmn1r172, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r172Q9EPS4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r172Q9EPS4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r172Q9EPS4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms