Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp2Q9EPK2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp2Q9EPK2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp2Q9EPK2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp2Q9EPK2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp2Q9EPK2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp2Q9EPK2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp2Q9EPK2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp2Q9EPK2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp2Q9EPK2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp2Q9EPK2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp2Q9EPK2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp2Q9EPK2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp2Q9EPK2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp2Q9EPK2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp2Q9EPK2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp2Q9EPK2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp2Q9EPK2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp2Q9EPK2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp2Q9EPK2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rp2Q9EPK2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rp2Q9EPK2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rp2Q9EPK2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp2Q9EPK2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms