Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD03

Rab13, Ras-related protein Rab-13, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab13Q9DD03 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Rab13Q9DD03 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Rab13Q9DD03 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Rab13Q9DD03 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
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Rab13Q9DD03 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Rab13Q9DD03 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Rab13Q9DD03 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Rab13Q9DD03 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Rab13Q9DD03 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab13Q9DD03 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rab13Q9DD03 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab13Q9DD03 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab13Q9DD03 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab13Q9DD03 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Rab13Q9DD03 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab13Q9DD03 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab13Q9DD03 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Rab13Q9DD03 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms