Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms