Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms