Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms