Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xab2Q9DCD2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xab2Q9DCD2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xab2Q9DCD2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xab2Q9DCD2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xab2Q9DCD2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xab2Q9DCD2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Xab2Q9DCD2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Xab2Q9DCD2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms