Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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