Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Hmg20aQ9DC33 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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