Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms