Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Manf-201ENSMUST00000069036 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms