Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms