Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smg9Q9DB90 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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