Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB27

Mcts1, Malignant T-cell-amplified sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcts1Q9DB27 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mcts1Q9DB27 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms