Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms