Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms