Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ift43Q9DA69 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ift43Q9DA69 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ift43Q9DA69 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Ift43Q9DA69 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Ift43Q9DA69 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ift43Q9DA69 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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