Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd8Q9DA37 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms