Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smco2Q9DA21 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms