Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgf29Q9DA08 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms