Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S4

Ctag2, Cancer/testis antigen 2, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctag2Q9D9S4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctag2Q9D9S4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctag2Q9D9S4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms