Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms