Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Usp12Q9D9M2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Usp12Q9D9M2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Usp12Q9D9M2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Usp12Q9D9M2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Usp12Q9D9M2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Usp12Q9D9M2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Usp12Q9D9M2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Usp12Q9D9M2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Usp12Q9D9M2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Usp12Q9D9M2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp12Q9D9M2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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