Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms