Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms