Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms