Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh4Q9D8F1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh4Q9D8F1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh4Q9D8F1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh4Q9D8F1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh4Q9D8F1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh4Q9D8F1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh4Q9D8F1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh4Q9D8F1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh4Q9D8F1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh4Q9D8F1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh4Q9D8F1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh4Q9D8F1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh4Q9D8F1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh4Q9D8F1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh4Q9D8F1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh4Q9D8F1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh4Q9D8F1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh4Q9D8F1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh4Q9D8F1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh4Q9D8F1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh4Q9D8F1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh4Q9D8F1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh4Q9D8F1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh4Q9D8F1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh4Q9D8F1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh4Q9D8F1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alkbh4Q9D8F1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkbh4Q9D8F1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms