Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms