Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B4

Ndufa11, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa11Q9D8B4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ndufa11Q9D8B4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa11Q9D8B4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ndufa11Q9D8B4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ndufa11Q9D8B4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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