Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms