Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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