Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms