Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc3Q9D6Y1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms