Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc94Q9D6J3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms