Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Rtl8cQ9D6I0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Rtl8cQ9D6I0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rtl8cQ9D6I0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rtl8cQ9D6I0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rtl8cQ9D6I0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rtl8cQ9D6I0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rtl8cQ9D6I0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rtl8cQ9D6I0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rtl8cQ9D6I0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rtl8cQ9D6I0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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