Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms