Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec23bQ9D662 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms