Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms